近代以来，随着中外交往的频繁，传统农商行政管理体制开始出现新的趋向。为了应付传统经济管理体制的不足，清政府增设了一些临时管理对外商务往来的行政机构，而商部的创设，则标志着中国第一个近代意义上专门管理全国实业的中央机构诞生。后来由于职权过于宽泛、经费不足而改为农工商部。辛亥革命后，革命党人建立南京临时政府，为了促进全国实业的发展，设立了实业部，各省成立实业司。袁世凯当选南北统一的临时大总统后，临时政府迁至北京，袁世凯及其北京政府十分重视实业的发展，在清农工商部和南京实业部整合的基础上成立了农商部，起初分立为农林、工商二部。