本书主要分为基础实验和综合与水产应用微生物实验两个部分，共包括30个实验。每个实验对实验原理进行了详细阐述；每个实验结合前人的经验总结了注意事项；每个实验后设置了一些思考题，可对实验进行复习并加深理解；书末附有全书所涉及的微生物常用培养基配方、染色液、常用消毒剂和相关微生物网站等。