本书共分为三部分。第一部分为生物反应器，包括生物反应器设计基础、通风发酵设备、厌氧发酵设备等；第二部分为产物分离提纯设备，包括过滤设备、离心分离设备、膜分离设备、萃取与色谱分离设备、蒸发设备、结晶设备、干燥设备等；第三部分为辅助系统设备，包括空气净化除菌设备及管道的清洗与灭菌设备等。