1199年，源赖朝去世。源赖朝死后，幕府政权被他的妻子北条政子和岳父北条时政掌握。自此幕府政权中将军成了摆设，实权则被北条氏世袭的执权所领导。1219年，北条义时唆使源赖家遗子源公晓暗杀源实朝，随后借此杀害源公晓，源氏家族绝嗣，北条政子成为统治者，并拥立与源氏有血缘关系的藤原赖经为将军。1221年，后鸟羽上皇策动倒幕战争，史称“承久之乱”，但以失败告终等。