主体功能区划是国土空间保护和利用科学配置的有效途径。在我国从粗放式开发国土空间、转向基于可持续发展目标认知国土空间的过程中，主体功能区划发挥了前瞻性、引导性、战略性和基础性的作用。主体功能区划的理论和方法论建设，为开展和实施主体功能区规划、战略和制度提供了重要的科学基础。其中，主体功能区划技术方法的探索始于2003年，当2006年全国“十一五规划”纲要采纳我们完成的主体功能区划阶段性成果时，主体功能区划技术方法还只是初步的。