本书共12章，主要内容包括总论，我国科研项目经费的相关定义，审计人员应了解国内外科研经费投入情况，中国科研创新发展态势，会计师事务所审计人员的历史使命，对重大专项项目经费审计案例的调查分析，对国家重点研发计划项目(课题)研发经费审计调查分析，对中央科技工业委托科研项目经费审计问题调查分析，对中央(地方)财政资金和其他来源资金工程建设企业科研项目经费审计问题调查分析，对中央(地方)财政资金或其他来源资金软件系统开发项目科研经费审计问题调查分析，对地方财政资金奖补科研经费项目审计问题调查分析，改进会计事务所对中央(地方)财政资金和其他资金研发经费审计体系建议。