本书共分六卷：卷之一论述《内经》十二官及阴阳、五行理论；卷之二论述中风及其后遗症与厥脱的鉴别，伤寒、温病、郁病的证治；卷之三专论血证并附有以上病证方剂；卷之四、卷之五主要论述六味丸、八味丸的组成与应用，滋阴降火、相火龙雷、阴虚发热等理论，以及痰、咳、吐血、喘、口疮、消渴、泻利、梦遗等的证治；卷之六主要论述补中益气汤及伤饮食、中暑、湿、疟、痢疾等的证治。该书立意于先天水火而尤重命门之火，对“命门学说”颇有发挥。本次校注以明崇祯元年(1628)重刻本为底本。