本书共分基础篇、临床篇、附录三部分。基础篇分别从中医、西医、中西医结合三方面论述消化系统疾病的病理特点、诊疗思路与方法、治则治法及用药规律；临床篇分别对各种消化系统疾病从中、西医两方面论述其病因病机、临床诊断、鉴别诊断、临床治疗等。对新经验、新成果特设“新疗法选粹”“名医治疗特色”“研究进展”“专方专药”进行专题介绍。