商务印书馆一直在出版太虚的《法相唯识学》这一巨著，而《太虚唯识论著精选集》在以下三方面与商务版不同：1.商务版以民国时期后来汇编的单行本为底本，我们以更原初的发表在各刊物上的文章为底本；2.商务版文章太多，但编排上没有循序渐进，初学者不知如何下手，我们对文章进行了精选，且基本按从易到难的次第来安排；3.补充了几篇商务版没有收入但十分重要的文章。太虚对唯识的探讨，融会贯通，且充分吸收当时新传入的西方科学和思想，因此充满着现代气息。