为了揭开尼斯湖怪兽这个谜团，人类开着轰隆隆的舰船和飞机，利用现代化的设备对尼斯湖进行了一次大搜索，更有甚者竟然不惜用破坏环境的方法来捉拿尼斯湖怪兽。为了拯救可怜的怪兽，电脑天才张小形用病毒程序致使前来搜索尼斯湖怪兽的宙斯号的主控制中心瘫痪……就在人们大失所望要打退堂鼓时，“校园三剑客”却发现了怪兽的蛛丝马迹，并潜入了尼斯湖底……他们能否揭开尼斯湖怪兽之谜?