本书内容首先对妙因寺建立的位置、修建者、宗教流派、历史沿革等背景进行介绍,接着对于妙因寺的曼荼罗图像进行大致的分类,图像包括大数量的藻井、天顶曼荼罗,壁画曼荼罗,以及唐卡和建筑部件上的绘制。主要部分则以天顶曼荼罗为代表,以寺院殿堂为单位,对曼荼罗进行统计、分类和描述,论述其各自特点和文献源流,并展开讨论其对于周边地区宗教和艺术的影响。