在向超高龄社会发展的基础上，由于引进了新的生物学药物和出现了多药耐药性菌，近年来，日见感染症的复杂化，多样化被指出。传染病的流行病学日新月异，其诊疗需要更新信息。消化管感染症的确诊需要病变部的病原微生物的检测。小肠大肠的感染症，作为检查体检查粪便检查，粪便培养也被通用，不过，因为上部消化管的感染症的诊断主要基于内视镜下生检和生检培养，检查中从内视镜观察到感染症有必要进行检查。肠内消化酶，肠内消化酶由十二指肠组织成是一种严酷的环境，因此除了H.pylori、轻度的关节炎、剧症型Annisakisu等一部分的感染症以外，在临床现场是遭遇频率较低的罕见疾病。但是，近年来由于HIV感染引起的免疫不全、类固醇药的长期内服、化学疗法中等免疫能力低下状态的患者增加人员，掌握上消化管感染症的知识很重要。