本书将发现的明清海防遗址细划为都司、营、卫、所、寨/屯、巡检司、墩、堡、炮台和其他(官兵家族墓地、祠堂等)十类，每类每处海防遗址均从地理环境、历史沿革、保存现状、历来工作、文献记载等方面进行了详细介绍，部分遗址还结合调查资料、文献和卫所官兵家谱记载，考证出其在古籍中的记载名称。