主体功能区是国家战略和地理学等诸多学科重大科学问题。其研究包括若干重要领域，之一是主体功能区区划。主体功能区区划是主体功能区规划和主体功能区示范等重要领域的基础。遵循人地关系地域系统理论、地理研究综合范式理论、综合自然地理区划理论和区域发展理论以及从定性到定量综合集成法等方法论，以地理环境（自然地理环境、人文地理环境、经济地理环境和综合地理环境）复杂多样的、作为一带一路重要节点的云南省为例，开展研究。这是不断发展和提升、总结的过程与结果。