科技创新发展战略研究共包括5个专题。第一个专题为“北京：科教中心如何才能成为创新中心”，本专题由国务院发展研究中心课题组完成。第二个专题为“平台建设是深化科技体制改革的重要抓手--中关村创新示范区调查”，本专题由国务院研究室教科文卫司课题组完成。第三个专题为“促进科技成果转化的政府科技项目管理研究”，本专题由科技部调研室、北京科学学研究中心课题组完成。第四个专题是“中关村’1+6’政策跟踪评价研究”，本专题由北京市科学技术研究院、北京决策咨询中心课题组完成。第五个专题为“首都经济圈地区科技合作与发展战略及其对策研究”，本专题由北京大学首都发展研究院课题组完成。