本书分为《游戏软件逃亡记》和《无言的航线(上)》两部分。《游戏软件逃亡记》讲述近期，一款游戏火爆全国，元太、步美和光彦带着柯南来到了这款游戏的制作公司。刚进制作公司大楼，元太突然想上厕所，结果他误打误撞地捡到了还未上市的游戏光盘，但这张光盘里储存着一些不可告人的秘密。为了拿回这张光盘，游戏制作公司的老板开启了疯狂的追逐行动，甚至想置元太他们于死地。《无言的航线(上)》讲述毛利小五郎受邀到冲绳电视台做谈话节目，柯南和小兰也跟着一起去了。可是没想到，在去往冲绳酒店的路上，他们发现了原定要跟毛利小五郎对话的棒球选手能势的尸体。能势被人刺死在路边，柯南怀疑能势的好友本山就是杀害他的凶手，可是本山却有充分的不在场证明。