本书将模型划分为两大类：第一类是关于科学表征的模型研究；第二类是关于科学语义的模型研究。本书不仅独立分析两类模型，也试图将两者进行交融性研究。同时结合科学史中的经典案例，以及在对模型与模拟研究的基础上，将研究成果扩展至对计算机模拟方法进行哲学思考，并最终延展至对计算思维、计算理念以及自然界的数学结构与建模的美学标准方面的讨论。