本书围绕一个尘封已久的花园展开。书中三个小主人公――一个性格孤僻、面黄肌瘦的小姑娘玛丽，一个脾气暴躁、疾病缠身的小少爷科林和一个可爱善良、健壮活泼的荒野小子迪肯，他们最重要的工作就是努力让这个死去的花园重新活过来。他们不停地拔草、松土、栽花、种树，殊不知，当他们让秘密花园渐渐苏醒的时候，他们自己也在消无声息地蜕变着：善良取代自私，开朗取代孤僻，宽和取代任性，健康取代病魔――他们和小树一起茁壮成长！