本书共分为5章。第1章“混菌发酵与微生物生态学”介绍了可控微生物菌群构建技术与微生物生态学的关系，主要从理论层面讨论可控混菌体系构建策略和技术创新；第2章~第5章，分别从食品酿造、能源开发、饲料加工和生物基化学品合成应用研究方面展开，论述了可控微生物混菌体系在上述行业领域的应用与创新。